近年來，高速發(fā)展的經(jīng)濟(jì)建設(shè)占用了大量耕地，耕地?cái)?shù)量銳減。若不抑制耕地減少趨勢，保持相當(dāng)數(shù)量的耕地，我國糧食安全問題將受到嚴(yán)重威脅。同時(shí)，我國土地利用粗放、大量土地閑置、土地資源利用效率低。因此，必須改革土地利用方式，推行土地整理，增加農(nóng)用地面積，尤其是耕地面積，實(shí)現(xiàn)耕地總量動(dòng)態(tài)平衡，從而保證經(jīng)濟(jì)建設(shè)持續(xù)發(fā)展。在此形勢下，1997年2月國務(wù)院發(fā)出通知，將土地整理作為進(jìn)一步加強(qiáng)土地管理的重要手段。1997年8月經(jīng)中央機(jī)構(gòu)編制委員會(huì)辦公室和原國家土地管理局批準(zhǔn)，在1998年1月組建成立了國家土地管理局土地整理中心，即現(xiàn)在國土資源部土地整理中心的前身。該中心是國土資源部負(fù)責(zé)土地開發(fā)整理工作的直屬事業(yè)單位，明確規(guī)定了在國家土地整理工作中肩負(fù)的任務(wù)。隨后，各地方政府的土地管理部門也開始設(shè)立相應(yīng)的專門負(fù)責(zé)土地整理工作的機(jī)構(gòu)，配合國土資源部土地整理中心的工作。1998年我國新頒布的《土地管理法》從法律的角度正式提出土地整理：土地整理逐步發(fā)展成為我國擴(kuò)大耕地面積，提高土地利用效率的重要手段之一。2000年，國土資源部土地整理中心成立土地整理規(guī)劃設(shè)計(jì)研究院，專門從事土地整理的技術(shù)和理論研究。

為指導(dǎo)和規(guī)范土地整理，2000年我國制定了《土地開發(fā)整理標(biāo)準(zhǔn)》，包含《土地開發(fā)整理規(guī)劃編制標(biāo)準(zhǔn)》、《土地開發(fā)整理項(xiàng)目規(guī)劃設(shè)計(jì)規(guī)范》、《土地開發(fā)整理項(xiàng)目驗(yàn)收規(guī)程》三項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)，這三項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)包含了土地整理工作的大部分技術(shù)層面，提供了全國統(tǒng)一的操作規(guī)程。同年頒布實(shí)施的還有《國家投資土地開發(fā)整理項(xiàng)目管理暫行辦法》和《土地開發(fā)整理項(xiàng)目資金管理暫行辦法》。2003年，我國制定了〈全國土地開發(fā)整理規(guī)劃》、《關(guān)于做好土地開發(fā)整理權(quán)屬管理工作的意見》，并下發(fā)了《土地開發(fā)整理若干意見》。2004年，我國頒布并實(shí)施了《土地開發(fā)整理規(guī)劃管理若干意見》。為了不斷完善和改進(jìn)我國土地整理工作，2005年，國土資源部下發(fā)了《關(guān)于加強(qiáng)和改進(jìn)土地開發(fā)整理工作的通知》。我國土地整理的管理制度體系逐步完善。

為進(jìn)一步開展和落實(shí)土地整理工作，國家明確規(guī)定土地有償使用費(fèi)專項(xiàng)用于耕地開發(fā)，并于2001年安排國家投資土地開發(fā)整理項(xiàng)目。截至2004年累計(jì)總投資135億元，整理土地94萬公頃，預(yù)計(jì)新增耕地27萬公頃。通過各個(gè)項(xiàng)目的實(shí)施取得了巨大的增地效益和經(jīng)濟(jì)效益。